Việc khử trùng cần gạt nước trong phòng sạch phải tuân theo nguyên tắc "làm sạch ban đầu để loại bỏ chất gây ô nhiễm, sau đó là khử trùng nghiêm ngặt và cuối cùng là sấy khô và bảo quản vô trùng". Các phương pháp cốt lõi bao gồm khử trùng bằng nhiệt (A0 Lớn hơn hoặc bằng 600) hoặc ngâm hóa chất đã được xác nhận (ví dụ: cồn 75% hoặc chất khử trùng-không chứa cặn cụ thể). Việc sử dụng chất khử trùng gốc clo-bị nghiêm cấm để ngăn chặn sự ăn mòn thiết bị hoặc ô nhiễm hạt.
Làm sạch trước khi xử lý: Sử dụng chất làm sạch ít xơ vải chuyên dụng để loại bỏ triệt để các hạt và cặn hữu cơ, đảm bảo chúng không ảnh hưởng đến quá trình khử trùng tiếp theo; nếu vết bẩn không được loại bỏ hoàn toàn thì bất kỳ phương pháp khử trùng nào cũng sẽ không hiệu quả.
Khử trùng bằng nhiệt (Ưu tiên): Sử dụng máy khử trùng-máy giặt công nghiệp để khử trùng bằng nhiệt ẩm, đảm bảo giá trị A0 Lớn hơn hoặc bằng 600 (tương đương 80 độ trong 10 phút, 90 độ trong 1 phút hoặc 93 độ trong 30 giây). Đun sôi tiêu chuẩn yêu cầu đun nóng liên tục ở 100 độ trong hơn 15 phút và chỉ áp dụng cho các vật liệu chịu nhiệt{12}}(bông/vải lanh); vật liệu sợi hóa học không phù hợp với phương pháp này.
Khử trùng bằng hóa chất: Hạn chế sử dụng cần gạt nước được thiết kế đặc biệt cho phòng sạch. Các phương pháp phổ biến bao gồm ngâm trong 75% cồn y tế-hoặc chất khử trùng không chứa cặn-đã được xác nhận. Thời gian liên hệ phải tuân thủ các yêu cầu xác thực quy trình (thường Lớn hơn hoặc bằng 30 phút). Việc sử dụng chất khử trùng gốc clo-bị nghiêm cấm do nguy cơ ăn mòn và tạo ra hạt.
